引言
在复杂的遗传病研究中，准确判读基因剪接位点变异的功能影响是阐明致病机制的关键挑战。近期，一项针对两个中国遗传性耳聋家系的研究，就展示了RDDC作为一款前沿的生物信息学分析工具，如何在关键的变异分析环节提供深度验证和分析支持。该研究不仅发现了MARVELD2基因的新型复合杂合变异，也通过RDDC工具的应用，为其中一个关键剪接变异的潜在功能影响提供了有力证据。
研究背景
遗传性耳聋是一种常见的感官障碍，其背后涉及复杂的遗传因素。在该研究中，科研人员对两个非综合征型耳聋家系进行了靶向二代测序，发现了一系列MARVELD2基因的新型变异。MARVELD2基因编码的tricellulin蛋白对维持内耳感觉上皮的屏障功能至关重要。
关键变异分析
剪接位点变异发现
在检测到的三种变异中，c.1331+1G>A尤为特殊。它位于一个经典的剪接位点附近，理论上可能会严重影响mRNA的成熟过程。为了探究其具体影响，研究团队首先使用了SpliceAI工具进行初步预测，结果显示该变异可能会改变原有剪接位点并激活一个新的剪接位点。
RDDC工具验证
为了进一步验证这一预测的可靠性并进行更深入的分析，研究者继而采用了RDDC工具。RDDC的分析结果明确支持了SpliceAI的预测，再次表明c.1331+1G>A变异极有可能导致剪接位点的改变和新剪接位点的激活。这一双重验证为该变异的潜在致病性提供了坚实的in silico（计算机模拟）证据。尽管由于缺乏后续的功能实验样本进行最终确认，该变异依据ACMG/AMP指南被评为"意义未明（VUS）"，但RDDC提供的分析结果无疑是评估其临床意义过程中不可或缺的一环。
研究意义
本项研究最终证实MARVELD2基因的新型复合杂合变异是导致这两个家系常染色体隐性遗传性耳聋的原因，扩展了耳聋的基因突变谱。在这个过程中，RDDC工具的应用清晰地展示了其在现代遗传学研究中的价值：它能够对其他工具的预测结果进行交叉验证，为研究者在面对功能未知的复杂剪接变异时，提供可靠的分析方向和决策依据，从而加深对疾病分子机制的理解。
内容来源与免责声明
本文是对以下科学研究的编译和解读，旨在展示 RDDC 生信工具在其中的应用。所有研究数据和结论归原作者和出版物所有。
原始文献：
Wang L, Guan J, Yang J, et al. Novel compound heterozygous variants in MARVELD2 causing autosomal recessive hearing loss in two Chinese families. Journal of Translational Medicine. 2023 Mar 23;21(1):241。
