引言
深度内含子变异（Deep Intronic Variants）是全外显子测序（WES）数据分析中的一大挑战，其功能后果难以预测。近期一项关于先天性眼睑缺损（CEC）的罕见病例报告，清晰地展示了RDDC-RNA splicer工具在攻克这一难题时的关键价值。该研究通过RDDC的精准预测，首次将JMJD6基因的一个新型de novo内含子变异与CEC表型相关联，提供了关键的in silico（计算机模拟）证据。
临床挑战：同卵双胞胎中的"VUS"变异
本研究的挑战来自一个特殊的病例：一对同卵双胞胎姐妹中，姐姐表现为左侧上眼睑全层缺损，而妹妹表型完全正常。这种表型不一致的情况为遗传分析带来了极大困难。WES检测在患儿体内发现了一个新型的de novo杂合变异：JMJD6基因的c.941+75G>T。
这是一个位于深内含子区的变异，在gnomAD等大型数据库中均未报道，其致病性完全未知。研究团队面临的核心问题是：这个深内含子变异是否是致病原因？以及它如何导致疾病的发生？
RDDC的精准预测：揭示假外显子插入
为了回答这个问题，研究团队使用了RDDC-RNA splicer工具来预测该变异对剪接的影响。RDDC的分析结果提供了关键且具体的致病机制假说：该c.941+75G>T变异可能导致一个长达485 bp的假外显子被异常插入到成熟的mRNA中。
这一预测意义重大。它清晰地表明，这个内含子变异并非无害，而是会通过假外显子插入导致下游读码框移位和蛋白提前终止，从而严重破坏JMJD6蛋白的功能。
案例启示
本案例有力地证明，RDDC-RNA splicer是科研工作者在面对WES/WGS数据中海量内含子VUS时的强大工具。它不仅能评估变异的潜在风险，更能提供具体的、可被验证的分子机制（如假外显子插入），为后续的功能实验（如RNA测序）提供了清晰的靶点和理论基础。
RDDC的这一预测功能，是首次将JMJD6基因变异与CEC关联起来的关键一步。
内容来源与免责声明
本文是对以下科学研究的编译和解读，旨在展示RDDC生信工具在其中的应用。所有研究数据和结论归原作者和出版物所有。
原始文献：
Case report: A novel intronic JMJD6 likely pathogenic variant (c.941+75G > T) associated with congenital eyelid coloboma in one of the identical twin sisters.
