登录|免费注册
中文工具简介与背景
序列比对是生物信息学中的关键操作，对于研究基因功能、进化关系以及疾病诊断等领域具有重要意义。该序列比对工具是基于 Needleman-Wunsch 比对算法进行开发的，能同时满足双序列比对和多序列比对的需求。
操作步骤详解
1、进入工具界面
打开浏览器，输入网址： https://rddc.tsinghua-gd.org/zh/tool/sequence-alignment ，进入序列比对首页。
2、添加序列
点击添加序列按钮，跳出弹窗用于添加序列，序列比对工具支持两种序列添加方式。
智能数据库调用模式：可通过在“基因名称:”处输入基因名或NCBI ID快速调取人源、小鼠、大鼠的基因序列进行比对分析。根据研究需求，在“序列:”下拉菜单处选择mRNA转录本（含不同剪接变体）、CDS编码区序列或对应的蛋白质翻译产物，以满足不同研究场景下的序列分析需求。
自定义输入模式：支持传统复制粘贴操作。例如，若需比对TP53基因在人和鼠中的MANE蛋白质序列，可按以下步骤操作：首先获取两条目标序列，点击【添加序列】按钮，将第一条序列复制至输入框后点击确认；再次点击【添加序列】按钮，复制第二条序列至输入框并确认添加。
3、输入或调取序列
每次添加都可以选择任意一种方式添加序列。每次只能添加一段序列。
4、提交获取结果
点击提交按钮，系统将进行序列比对分析，随后即可获得比对结果页。
5、查看与分析结果
在比对结果页，仔细查看比对结果，包括序列的相似性、差异位点等信息，以便进行后续的科研分析。
比对结果分析（蛋白质序列比对为例）：
紫色高亮：在氨基酸序列比对结果中，紫色高亮区域表示两序列对应位置的氨基酸存在显著差异，包含氨基酸缺失的情况。
星号（
）：标识两条或多条氨基酸序列中，相似位点的氨基酸完全一致。
）：标识两条或多条氨基酸序列中，相似位点的氨基酸完全一致。双星号（
）：表示两条或多条氨基酸序列的相似位点处，氨基酸虽不保守但具有相似性。该相似性通常体现在残基的物理化学性质上，例如同为极性氨基酸、疏水性氨基酸，或带有相同电荷等。
）：表示两条或多条氨基酸序列的相似位点处，氨基酸虽不保守但具有相似性。该相似性通常体现在残基的物理化学性质上，例如同为极性氨基酸、疏水性氨基酸，或带有相同电荷等。辅助功能与资源
视频讲解：点击页面中的【视频讲解】链接，观看官方操作演示。
应用场景举例
科研场景：比对物种同源基因序列，构建系统发育树，探究进化关系；分析基因敲除前后序列，定位功能区域。
临床场景：比对肿瘤与正常组织序列，指导靶向治疗；筛查遗传疾病致病突变，辅助早期诊断。
教学场景：展示基因结构特征，演示遗传变异原理；用于实践操作训练，培养生物信息学技
产业场景：比对酶序列，优化工业用酶性能；研究微生物序列，提升发酵产物质。
