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AAV衣壳产量预测模型
简介
AAV ViaPredictor赛业生物与清华珠三角研究院人工智能创新中心联合开发的一款基于AI模型的AAV产量预测工具。该工具通过整合多维度特征数据与深度学习框架,实现对不同血清型载体的产量预测,为基因治疗药物的研发与生产提供精准、高效的产量优化支持。
操作说明
工具接收AAV2血清型的碱基序列,以此完成产量预测,具体应用条件如下:
图1. 操作示意图,其中输入的片段只能为碱基序列
AAV2血清型
突变支持范围:
仅限在野生型587-588氨基酸位点间插入21-30个碱基(7-10个氨基酸)的变体。
参考序列:
野生型561-592位点序列:DEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGN^RQAAT("^"标识为587-588插入位点)。
插入结构:自动添加N端酶切序列"TG"和C端酶切序列"GLS",形成"TG~GLS"格式,其中"~"表示输入的片段。
注意:需要输入的是碱基序列,而不是氨基酸序列。
知识回顾
结果为一个数据表,列sequence为输入的序列,列score为模型预测的分数(
分数已使用log2进行缩放
),其中score越高代表产量越高,具体如下:
sequence
score
AAV2 WT
1.13
input sequences
prediction score
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