大鼠

Plec - plectin

别称:
Pcn
Pltn
Plec1
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基础信息
物种序列比对
转录本 & 蛋白质
基因表达量
蛋白相互作用
相关模型
文献报道
假基因是一种重要的结构相关蛋白质家族的成员,这个家族被称为plakins或细胞连接器,它们能够连接细胞骨架的不同元素。plakins具有多结构域结构和巨大的大小,不仅在维持细胞和组织完整性以及协调细胞结构和细胞形状的动态变化中起着关键作用,还作为信号复合物的组装、定位和调节的支架平台。plectin在人类染色体8上的一个基因中以各种蛋白质异构体的形式表达,直到2010年,这个位置被命名为plectin 1(人类中的符号为PLEC1,小鼠和大鼠中的符号为Plec1),基因产物被称为“hemidesmosomal protein 1”或“plectin 1, intermediate filament binding 500kDa”。这些名称被plectin取代。小鼠染色体15上的plectin基因座已经详细分析(PMID: 10556294,14559777),揭示了一个具有超过40个外显子、跨越62kb的基因组外显子-内含子组织以及plectin异构体的一种非典型的5'转录复杂性。已经发现了11个可替代地剪接进入通用外显子2的替代外显子(1-1j),外显子2是第一个编码plectin的高度保守的肌动蛋白结合结构域(ABD)的外显子。三个额外的外显子(-1,0a和0)剪接到一个可选的第一编码外显子(1c)中,另外两个额外的外显子(2alpha和3alpha)在编码肌动蛋白结合结构域(外显子2-8)的外显子中可选地剪接。人类基因座的分析已经发现了小鼠和鼠11个替代5'外显子中的8个(PMID: 14672974);外显子1i、1j和1h在人中尚未得到确认。此外,在小鼠(PMID:10556294)、大鼠(PMID: 9177781)和人类(PMID: 11441066,10780662,20052759)中,已经发现了缺乏由外显子31编码的中央棒状域的异构体。不同第一外显子编码的短替代氨基末端序列将各种异构体定向到细胞内的不同位置(PMID: 14559777)。特定plectin异构体的表达被发现取决于细胞类型(组织)和发育阶段(PMID: 10556294,12542521,17389230),似乎每种细胞类型(组织)都包含一组(比例和组成)独特的plectin异构体,仿佛专为特定细胞的需求定制。相应地,已经发现各个异构体执行独特和特定的功能(PMID: 14559777,12542521,18541706)。1996年,一些小组报告说,患有简单皮肤炎性肌营养不良(EBS-MD)的患者由于plectin基因的缺陷而在皮肤和肌肉组织中缺乏plectin表达(PMID: 8698233,8941634,8636409,8894687,8696340)。已经描述了与plectin相关的EBS的其他两种亚型:EBS-pyloric atresia(PA)和EBS-Ogna。有关plectin相关疾病的综述,请参阅PMID: 15810881,19945614。与人类疾病相关的plectin基因突变应以位于NM_000445(人类变异1,异构体1c)中的位置命名,除非突变位于其他替代第一外显子中,在这种情况下,应使用相应的参考序列中的位置。[由RefSeq,2011年8月提供]
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基础信息

NCBI
转录本
外显子
基因长度
分子量
相关模型
参考文献
33
32
61337 bp
Unknown
13
3

Plec遗传学信息(-)

mRatBN7.2

物种序列比对

转录本 & 蛋白质

表格展示
图形展示
#
转录本
长度(nt)
外显子数量
CDS(bp)
蛋白质
长度(aa)
暂无相关数据
* 该模块数据来源于NCBI

基因表达量

RNA组织特异性表达

系统排序
表达量排序
字母排序

RNA细胞特异性表达

组织排序
表达量排序
字母排序

蛋白相互作用

作用蛋白
调控方式
调控细节
作用机制
靶蛋白
氨基酸残基
原文链接
分值
暂无相关数据

相关模型

类型
名称
MGI
品系来源
文献数量
突变类型
暂无相关数据

文献报道

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PMID
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暂无数据
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