大鼠

Egln1 - egl-9 family hypoxia-inducible factor 1

Alias:
PHD2
HPH-2
PHD-2
HIF-PH2
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Basic Information
Sequence Homology
Transcripts & Proteins
Gene Expression
Interactions
Related Mouse Models
References Literature
这个基因编码一个转录复合物的成分,该复合物在哺乳动物氧气平衡中起着核心作用。低氧降低脯氨酸羟化酶的活性,该酶对低氧诱导因子1a(Hif1a)的特定脯氨酸残基进行羟化。在羟化缺失的情况下,Hif1a转录因子积累并激活缺氧响应靶基因的转录。这个基因编码大鼠中已知的三种Hif相互作用2-氧戊二酸/铁依赖性脯氨酸羟化酶(HIF-PHDs)之一。在小鼠中针对这个基因的靶向破坏产生胚胎致死性,发生在胚胎第12.5天和第14.5天之间。根据目前可用的大鼠转录数据,认为这个参考序列包含这个基因的完整编码区。然而,与其小鼠和人正链同源物相比,它具有较短的5'编码区和不完整的N-末端zf-MYND结构域。目前,这个位点的转录数据有限,并与大鼠参考基因组组装的未完成区域对齐。因此,不确定其编码区是否可以在5'端延伸以编码完整的zf-MYND结构域,是否不需要对其编码区进行进一步更改,或者它是否是不编码功能性蛋白质的转录假基因。随着更多的转录和实验数据可用,这个位点的编码状态可能会改变。[由RefSeq,2008年7月提供]

Basic Information

NCBI
Transcripts
Exons
Length
MW (kDa)
Related Mouse Models
Reference
1
5
39409 bp
Unknown
14
--

Egln1 Genetics information (-)

mRatBN7.2

Sequence Homology

Transcripts & Proteins

Table View
Tile View
#
Transcript
Length(nt)
Exon Count
CDS(bp)
Protein
Length(aa)
No data available
* This data comes from NCBI.

Gene Expression

Tissue-specific RNA expression

Organ
Abundance
Alphabetical

Cell-specific RNA expression

Organ
Abundance
Alphabetical

Interactions

Acting
Regulation
Detail
Mechanism
Target
Residues
Reference
Score
No data available

Related Mouse Models

Type
Name
MGI
Strain of Origin
Publications
Mutations
No data available

References Literature

Title
PMID
Journal
Year
IF
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Sequence
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