Cdh3小鼠基因|Cdh3基因功能|Cdh3小鼠模型-RDDC官网

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COL4A5 c.1390G>A ALS1 DMD c.1332-11868C>G TP53 肌萎缩侧索硬化症1型 USH2A c.8559-2A>G 囊性纤维化

小鼠

Cdh3 - cadherin 3

别称:

Cadp

Cdhp

Pcad

P-cadherin

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基础信息

物种序列比对

转录本 & 蛋白质

基因表达量

蛋白相互作用

相关模型

文献报道

这个基因编码一个含五个钙粘蛋白结构域的钙依赖性细胞间粘附蛋白。编码的蛋白质在上皮细胞生长中发挥作用，例如在毛囊和肢芽发育过程中发生的作用。人类相关基因功能丧失导致外胚层发育不良、多指畸形、黄斑变性以及先天性毛囊稀疏和幼年黄斑变性。这个基因位于染色体8上类似钙粘蛋白基因附近。前体蛋白进一步切割成一个有功能的链。可选的剪接导致多个转录变异体。[RefSeq,2013年3月提供]

查看原文参与反馈

This gene encodes a calcium-dependent cell-cell adhesion protein containing five cadherin domains. The encoded protein plays a role in epithelial outgrowth, such as that which occurs during the development of hair follicles and limb buds. Loss of function of the related gene in humans results in ectodermal dysplasia, ectrodactyly, and macular dystrophy and congential hypotrichosis with juvenile macular dystrophy. This gene is located in the vicinity of similar cadherin genes on chromosome 8. The proprotein is further cleaved into a functional chain. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2013]

相关ID：

ENSEMBL：ENSMUSG00000061048

UNIPROT：P10287

基础信息

NCBI

转录本

外显子

基因长度

分子量

相关模型

参考文献

2

16

46060 bp

90.61

3

12

Cdh3遗传学信息（+）

GRCm39

Chr 8: 107237484 - 107283543

Cdh3附近基因：6

物种序列比对

同源小鼠基因:

Cdh3查看基因序列

同源人类基因:

CDH3 查看基因序列

同源大鼠基因:

Cdh3 查看基因序列

基因长度
人类	Chr 16	88462 bp
小鼠	Chr 8	46060 bp
大鼠	Chr 19	50489 bp
外显子数量
人类	NM_001793.6	16
小鼠	NM_001037809.5	16
大鼠	NM_053938.2	16

转录本长度
人类	NM_001793.6	4452 bp
小鼠	NM_001037809.5	4037 bp
大鼠	NM_053938.2	3458 bp
同源性序列比对
人类	NM_001793.6	82.0%
小鼠	NM_001037809.5	100%
大鼠	NM_053938.2	92.5%

蛋白质长度
人类	NP_001784.2	829 aa
小鼠	NP_001032898.1	822 aa
大鼠	NP_446390.2	822 aa
蛋白质同源性序列比对
人类	NP_001784.2	82.0%
小鼠	NP_001032898.1	100%
大鼠	NP_446390.2	92.8%

转录本 & 蛋白质

当前研究发现，Cdh3基因存在2种不同的转录本和2种不同的蛋白质变体。

表格展示

图形展示

#

转录本

长度(nt)

外显子数量

CDS(bp)

蛋白质

长度(aa)

1

NM_001037809.5MANE

4037

16

2469

NP_001032898.1

822

2

4034

16

2466

NP_031691.1

821

* 该模块数据来源于NCBI

基因表达量

RNA组织特异性表达

系统排序

表达量排序

字母排序

神经系统

内分泌&免疫系统

呼吸循环系统

消化系统

泌尿&生殖系统

其他

蛋白相互作用

作用方式

上下游

作用机制

物种

组织

细胞

作用蛋白

调控方式

调控细节

作用机制

靶蛋白

氨基酸残基

参考文献

分值

Cdh3

活性

结合

0

1

0.86

数量（稳定）

结合

Cdh3

0

1

0.734

数量（稳定）

结合

Cdh3

0

1

0.322

数量（稳定）

结合

Cdh3

0

1

0.295

共4个结果, 每页展示10条

1

相关模型

类型

名称

MGI

品系来源

文献数量

突变类型

基因编辑小鼠

C57BL/6JCya-Cdh3^em1/Cya

--

C57BL/6JCya

--

敲除

基因编辑小鼠

C57BL/6JCya-Cdh3-flox^em1flox/Cya

--

C57BL/6JCya

--

条件性敲除

基因编辑小鼠

129S2/SvPas

8

基因内删除

共3个结果, 每页展示10条

1

文献报道

文献数量

案例报告 (0)

临床研究 (0)

评论 (0)

指南 (0)

期刊文章 (12)

快报 (0)

Meta-分析 (0)

比较研究 (0)

多媒体文献 (0)

综述 (0)

其它 (0)

标题

PMID

期刊

年代

IF

Functional annotation of a full-length mouse cDNA collection.

Nature

2001

64.8

Analysis of the mouse transcriptome based on functional annotation of 60,770 full-length cDNAs.

Nature

2002

64.8

Genomic organization and chromosomal mapping of the mouse P-cadherin gene.

Nucleic acids research

1991

14.9

Normalization and subtraction of cap-trapper-selected cDNAs to prepare full-length cDNA libraries for rapid discovery of new genes.

Genome research

2000

7

RIKEN integrated sequence analysis (RISA) system--384-format sequencing pipeline with 384 multicapillary sequencer.

Genome research

2000

7

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).

Genome research

2004

7

The 5' flanking sequences of the mouse P-cadherin gene. Homologies to 5' sequences of the E-cadherin gene and identification of a first 215 base-pair intron.

Journal of molecular biology

1993

5.6

A comprehensive survey of the cadherins expressed in the testes of fetal, immature, and adult mice utilizing the polymerase chain reaction.

Biology of reproduction

1996

3.6

High-efficiency full-length cDNA cloning.

Methods in enzymology

1999

1.7

Antisense transcription in the mammalian transcriptome.

Science (New York, N.Y.)

2005

--

共12个结果, 每页展示10条

1

2

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原英文文本：

This gene encodes a calcium-dependent cell-cell adhesion protein containing five cadherin domains. The encoded protein plays a role in epithelial outgrowth, such as that which occurs during the development of hair follicles and limb buds. Loss of function of the related gene in humans results in ectodermal dysplasia, ectrodactyly, and macular dystrophy and congential hypotrichosis with juvenile macular dystrophy. This gene is located in the vicinity of similar cadherin genes on chromosome 8. The proprotein is further cleaved into a functional chain. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2013]

原翻译后文本：

这个基因编码一个含五个钙粘蛋白结构域的钙依赖性细胞间粘附蛋白。编码的蛋白质在上皮细胞生长中发挥作用，例如在毛囊和肢芽发育过程中发生的作用。人类相关基因功能丧失导致外胚层发育不良、多指畸形、黄斑变性以及先天性毛囊稀疏和幼年黄斑变性。这个基因位于染色体8上类似钙粘蛋白基因附近。前体蛋白进一步切割成一个有功能的链。可选的剪接导致多个转录变异体。[RefSeq,2013年3月提供]

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